הסבר: הבנת מוטציה שופעת, ניתנת להעברה גבוהה של נגיף הקורונה
מוטציות Covid-19: עד כה, 12,000 מוטציות תועדו ביותר מ-3.2 מיליון מקרים ברחבי העולם. נמצאה מוטציה אחת הנפוצה ביותר. זה הבחין לראשונה בסין ובגרמניה.
נגיפי RNA כגון SARS-CoV-2 עוברים מוטציה איטית מכיוון שהם דורשים מארח (תא אנושי) על מנת להתרבות. (תצלום קובץ/ייצוג) נגיף הקורונה SARS-CoV-2 עובר מוטציה מתמדת, אך מוטציה אחת במיוחד תפסה את עיני החוקרים בשל השפע שלה. שמו D614G, מוטציה זו נמצאה ניתנת להעברה יותר מרוב האחרות.
מהי מוטציית D614G?
כל הנגיפים עוברים מוטציות כדי להסתגל למחסומים שבני אדם מציבים. נגיפי RNA כגון SARS-CoV-2 עוברים מוטציה איטית מכיוון שהם דורשים מארח (תא אנושי) על מנת להתרבות.
עד כה, 12,000 מוטציות תועדו ביותר מ-3.2 מיליון מקרים ברחבי העולם. נמצאה מוטציה אחת הנפוצה ביותר. הוא הבחין לראשונה בסין ובגרמניה, אך זכה לתשומת לב כאשר הוא צץ במספר מקרים ברחבי אירופה, ובסופו של דבר בארה'ב, קנדה, אוסטרליה והודו. במוטציה זו, גליצין (G) מחליף חומצה אספרטית (D) במיקום ה-614 בחומצת האמינו. מכאן שהמוטציה מכונה 'D614G'.
IND614G,G (גליצין) מחליף את D (חומצה אספרטית) במיקום 614. (קורברת אל/תא) מה הופך את המוטציה הזו לשונה מאחרות?
כדי להבין זאת, עלינו להבין כיצד SARS-CoV-2 נכנס לתא אנושי. חומצות האמינו שבהן מתרחשת מוטציה ממוקמות בחלבון הספייק של הנגיף. חלבוני הספייק נקשרים לקולטן ACE2 בתא האנושי ומקבלים כניסה.
ד'ר ראג'ש פאנדי, מדען ב-CSIR-Institute of Genomics and Integrative Biology, הסביר, הפפטידים בחלבון הספייק הם הננעלים עם הקולטן ACE2. במוטציה של D614G, שניים משלושת הפפטידים נפתחים, מה שהופך את סיכויי הכניסה לתא אנושי גבוה יותר. דמיינו יד עם שלוש אצבעות. אם רק אצבע אחת נפתחת, יש לה גישה מוגבלת לאסוף חפצים, אבל אם שתי אצבעות נפתחות, הן יכולות להרים חפצים נוספים. שני הפפטידים מגבירים את הסיכוי שהנגיף יכנס לתא אנושי.
מכיוון שטבעו מאפשר סיכוי טוב יותר להיכנס לתא מארח מאשר זנים אחרים שעברו מוטציה, ל-D614G יש קצב שידור גבוה יותר. GISAID, מסד נתונים עולמי של וירוסים שתיעד את כל הזנים המסתובבים של SARS-CoV2, מראה שהזן המוטציה זכה לבולטות ממרץ ואילך באירופה.
הסבר אקספרסמופעל כעתמִברָק. נְקִישָׁה כאן כדי להצטרף לערוץ שלנו (@ieexplained) והישאר מעודכן בחדשות האחרונות
מה ההשלכות של זה?
וירוס עובר מוטציה בכל פעם שהוא משתכפל בתא האנושי כדי להסתגל ולשרוד. המוטציה הזו עוזרת לנגיף לעשות בדיוק את זה. עד תחילת מרץ, מוטציה זו הייתה נדירה אך צברה דומיננטיות באירופה, כך עולה מנתוני GISAID.
מאמר ב-Cell נצפה: לפני 1 במרץ 2020, זה (D614G) נמצא ב-10% מ-997 רצפים גלובליים; בין 1 במרץ ל-31 במרץ 2020, הוא ייצג 67% מ-14,951 רצפים; ובין 1 באפריל ל-18 במאי 2020 הוא ייצג 78% מ-12,194 רצפים.
מסמך טרום-הדפסה ב-Medrxiv מצא שלמטופלים שנדבקו במוטציה זו יש עומס וירוסים גבוה משמעותית בלוע האף באבחון הראשוני. המחקר רצף גנומים של 5,085 זני SARS-CoV-2 ביוסטון.
הזן גדל, הועבר מהר בגלל הקלות שבה הוא מקבל כניסה לתא. זה מה שנתן לו הייפ, אמר המיקרוביולוג ד'ר ג'יאנטי שאסטרי, ממעבדת קסטרבה, מומבאי. שאסטרי אמר שמחקרים ראשוניים הראו ש-D614G יכול להוביל ליותר שידור ולתסמינים חמורים. בתחילה אכן ראינו זיהומים חמורים, אך ככל שחלף הזמן ראינו בדגימות שלנו שלא ניתן לקשר בין זיהומים ישירות למוטציה, גם גורמים נלווים אחרים משחקים תפקיד, אמרה. עד כה, אין מספיק מחקרים אורך כדי לצייר קשר ישיר בין D614G לתמותה מוגברת. בשביל זה אנחנו צריכים לעשות רצף גנום עבור מספר חולים חמורים כדי לבדוק אם מוטציה זו קיימת, אמר שאסטרי.
גם בהסבר | מחקר חדש: מלחים באף עשירים בסידן הוכחו כמפחיתים אירוסול נשוף
האם זה נפוץ בהודו?
ה-Lancet פרסם טרום-הדפסה של הדבקה חוזרת ב-Covid-19 בארבעה עובדי בריאות במומבאי. המחקר של בית החולים Kasturba, המרכז הבינלאומי להנדסה גנטית וביוטכנולוגיה ו-CSIR- המכון לגנומיקה וביולוגיה אינטגרטיבית מצא מוטציה של D614G בשלושה מהם. אצל רופא אחד שנדבק מחדש בפעם השנייה, הייתה קיימת מוטציית D614G. הוא פיתח תסמינים חמורים ונזקק לטיפול בפלזמה. אבל אנחנו לא יכולים להיות בטוחים לקשר ישירות את D614G עם חומרת הזיהום, אמר שאסטרי.
אצל רופא אחר, D614G היה קיים בזיהום הראשון אך הוא לא הוביל לתסמינים חמורים.
האם המוטציה עלולה לגרום למוות, או שניתן להתמודד איתה באמצעות חיסונים, אינו ידוע במלואו. כמה מחקרים הצביעו על כך שזה לא מוביל לזיהום חמור בריאות.
האם זה יעד חיסון?
השפע שלו מציע לחוקרים הזדמנות ללמוד ולמקד את המנגנון שלו. פייזר עובדת על מועמד לחיסון שבו נוגדנים יחסמו את תחום קושרת הקולטן בנגיף. הניסוי הגרמני של החיסון הראה תוצאות מבטיחות נגד זן D614G.
מאמר טרום-דפוס ב-Biorxiv ב-2 בספטמבר היה אופטימי כי ייתכן שהמוטציה לא תפחית את יעילות החיסון נגדה.
שתף עם החברים שלך:
