הסבר: מהו 'ערך CT' במבחן Covid-19, ומדוע הוא חשוב?

ערך סף המחזור עולה בבדיקות RT-PCR לנגיף הקורונה, וקובע אם אדם חיובי לקוביד-19 או לא. באיזו מידה זה מתאם עם עומס ויראלי וחומרת המחלה?

בדיקת RT-PCR מזהה את הנגיף; ערך Ct קובע אמת מידה אם אדם אמור להיחשב כחיובי. (צילום אקספרס: עמית מהרה)

בין מונחים מדעיים שונים שמגפת Covid-19 הפכה לחלק מאוצר המילים הציבורי, אחד מהם הוא 'ערך Ct' במבחני RT-PCR כדי לקבוע אם חולה חיובי ל-Covid-19.

זה היה הנושא של בקשה ששלחה לאחרונה ממשלת מהרשטרה למועצה ההודית למחקר רפואי (ICMR). המדינה ביקשה להבהיר האם כדאי להתייחס לאדם כשלילי לקוביד אם ערך ה-Ct הוא יותר מ-24 והאדם הוא א-סימפטומטי. גורמים רשמיים במדינה אמרו כי מסמכים שונים של ICMR הזכירו ערכי Ct שונים וקיימות דעות שונות אפילו בקרב ניטי איוג והמרכז הלאומי לבקרת מחלות.

ימים לאחר מכן, ה- ICMR DG כתב בחזרה לשר הבריאות של המדינה כי ICMR לקח תשומות ממעבדות וירולוגיה ברחבי הארץ כדי להגיע לחתוך ערך Ct בודד. כל החולים עם ערך Ct נמוך מ-35 עשויים להיחשב כחיוביים ואילו אלו עם ערך Ct מעל 35 עשויים להיחשב כשליליים, אמר ICMR.

אבל מהו ערך Ct?

קיצור של סף מחזור, Ct הוא ערך שמופיע במהלך בדיקות RT-PCR, תקן הזהב לזיהוי נגיף הקורונה SARS-CoV-2. בבדיקת RT-PCR, RNA מופק מהספוגית שנאספת מהמטופל. לאחר מכן הוא הופך ל-DNA, אשר לאחר מכן מוגבר. הגברה מתייחסת לתהליך של יצירת עותקים מרובים של החומר הגנטי - במקרה זה, DNA. זה משפר את יכולת הבדיקה לזהות נוכחות של וירוס. ההגברה מתבצעת באמצעות סדרה של מחזורים - עותק אחד הופך לשני, שני הופך לארבעה וכן הלאה - ולאחר מספר מחזורים נוצרת כמות ניתנת לזיהוי של וירוס.

על פי ייעוץ ICMR, ערך ה-Ct של תגובת RT-PCR הוא מספר המחזורים שבהם ניתן לזהות את הקרינה של תוצר ה-PCR מעבר לאות הרקע. במילים פשוטות, ערך Ct מתייחס למספר המחזורים שלאחריהם ניתן לזהות את הנגיף. אם נדרש מספר גבוה יותר של מחזורים, זה מרמז שהנגיף לא זוהה כאשר מספר המחזורים היה נמוך יותר. ככל שערך Ct נמוך יותר, כך העומס הנגיפי גבוה יותר - מכיוון שהנגיף זוהה לאחר פחות מחזורים.

ניוזלטר| לחץ כדי לקבל את הסברים הטובים ביותר של היום בתיבת הדואר הנכנס שלך

מדוע ערך ה-CT חשוב?

כדי לשים את זה בהקשר, הבה נסתכל על הייעוץ של ICMR ועל המכתב של מהרשטרה ל-ICMR. לפי ה-ICMR, חולה נחשב לחיובי ל-Covid אם ערך ה-Ct נמוך מ-35. במילים אחרות, אם ניתן לזהות את הנגיף לאחר 35 מחזורים או קודם לכן, החולה נחשב חיובי. אם המדד היה יורדת ל-24 - הערך המוזכר במכתבו של מהרשטרה - זה אומר שערכי Ct בטווח 25-34 לא ייחשבו חיוביים. אם כן, מדד של 35 אומר שיותר מטופלים ייחשבו חיוביים ממה שהיינו מקבלים אם המדד היה 24. ה-ICMR אמר שהורדת פרמטר סף Ct עשויה להוביל להחמצת מספר אנשים מידבקים.

אפשר לחשוב על ערך Ct כמדד לפוטנציאל ההעברה, אמר הוירולוג המוביל ד'ר שאהיד ג'מייל. אז אם יש יותר וירוס בגרון ובאף, אני אעביר אותו טוב יותר, אמר ד'ר ג'מייל, שהוא מנהל בית הספר למדעי הביולוגי טריוודי באוניברסיטת אשוקה.

מהי המשמעות של סף ICMR של 35?

ברחבי העולם, הסף המקובל לערך Ct עבור Covid-19 נע בין 35 ל-40, בהתאם להנחיות מהיצרנים המתאימים של ציוד הבדיקה. ה-ICMR הגיע לערך Ct של 35 בהתבסס על חוויות מעבדה ותשומות שנלקחו ממספר מעבדות וירולוגיה.

לא הייתה ייעוץ חדש, אבל ICMR הודיעה לממשלת מהרשטרה שלא כדאי להשתמש בפרמטר סף מחזור נמוך יותר מכיוון שזה יוביל להחמצת מספר אנשים מידבקים ולהגביר את העברת המחלות, אמר ד'ר באלרם בהרגבה, DG של ICMR.

האם יש מתאם בין ערך Ct לבין חומרת המחלה?

לא. למרות שערך Ct נמצא בקורלציה הפוכה לעומס נגיפי, אין לו כל השפעה על חומרת המחלה, אמרו מומחים. למטופל יכול להיות ערך Ct נמוך, מה שאומר שהעומס הנגיפי שלה גבוה מספיק כדי להתגלות במהירות, אבל היא עדיין עשויה להיות א-סימפטומטית.

מחקר קטן שפורסם בכתב העת Indian Journal of Medical Microbiology בינואר השנה מצא כי אין מתאם בין ערכי Ct לבין חומרת המחלה או התמותה בחולים עם מחלת Covid-19. הוא מצא שלזמן מאז הופעת התסמינים יש קשר חזק יותר עם ערכי Ct בהשוואה לחומרת המחלה.

ערך ה-Ct מספר לנו על העומס הנגיפי בגרון ולא בריאות, אמר ד'ר פאריקשיט פראיאג, יועץ למחלות זיהומיות בבית החולים דינאנת מאנגשקר, פונה. ערך Ct אינו מתאם עם חומרה - רק עם זיהום. בדו'ח הראשון אני לא באמת מסתכל על ערך ה-Ct, אבל לצורך מעקב אחר חולים בבית החולים, אני כן שוקל את ערך ה-Ct, שכן אז אני יכול להחליט אם להעביר את החולה לבניין שאינו קוביד או לא. . מנקודת המבט של הדבקות, זה יכול להשפיע, לא לחומרה, אמר ד'ר פראיאג.

האם ערך Ct גבוה אומר תמיד עומס ויראלי נמוך?

למרות שזו עשויה להיות ההסקה הברורה, חלק מהמומחים מדגישים שלחלק מהחולים יכול להיות ערך Ct גבוה ובכל זאת יש להם רמה משמעותית מאוד של זיהום Covid-19, ולהיפך. גורמים רבים חשובים בפירוש בדיקת RT-PCR, והתוצאות עשויות להיות תלויות גם בשיטת איסוף הדגימה ובזמן מההדבקה לאיסוף ולניתוח.

ייעוץ של ICMR באוגוסט בשנה שעברה ציין כי ערכי Ct תלויים באופן איסוף המדגם. מדגם שנאסף בצורה גרועה עשוי לשקף ערכי Ct לא הולמים. חוץ מזה, ערכי Ct נקבעים גם על ידי הכשירות הטכנית של האדם שמבצע את הבדיקה, כיול הציוד והכישורים האנליטיים של המתורגמנים.

שוב, ערכי Ct עשויים להיות שונים בין דגימות האף והלוע שנאספו מאותו אדם. טמפרטורת ההובלה, כמו גם הזמן הנמשך מהאיסוף ועד הקבלה במעבדה, עלולים גם הם להשפיע לרעה על ערכי Ct.

שתף עם החברים שלך: