הסבר: חמישה שלבים לגילוי נגיף הקורונה (COVID-19)

התהליך הוסבר ל-The Indian Express על ידי ד'ר V Ravi, פרופסור בכיר וראש המחלקה לנוירוווירולוגיה, NIMHANS.

דם מזויף נראה במבחנות המסומנות בנגיף הקורונה (COVID-19) באיור זה שצולם ב-17 במרץ 2020. (רויטרס)

ד'ר V Ravi, פרופסור בכיר וראש המחלקה לנוירוווירולוגיה, NIMHANS, מסביר את תהליך גילוי נגיף הקורונה האתר הזה . להלן חמשת השלבים:

איסוף והובלה

מרכז הבדיקה לוקח ספוגיות מחלל האף ומחלק האחורי של הגרון (לוע), ומכניס דגימות למצע להובלת וירוסים, המכיל מלחים מאוזנים ואלבומין כדי למנוע מהנגיף להתפורר. לאחר מכן הדגימה מועברת באחסון קר למעבדת הבדיקה.

מיצוי RNA ויראלי

נגיפים כמו SARS-CoV (שהופיעו בסין בשנים 2002-03), MERS-CoV (שהופיעו בסעודיה ב-2012), או SARS-CoV-2 הנוכחי שגרם למגפת COVID-19, , גנום RNA חד-גדילי. מעבדת הבדיקה מחלצת את ה-RNA מהדגימות, באמצעות ערכות זמינות מסחרית (כגון אלה המיוצרות על ידי חברות כמו QIAGEN.)

הכנסת ה-RNA לתערובת ה-PCR

RNA מופק מתווסף לתערובת שרשרת פולימראז (PCR). זה כולל את ה- 'מאסטר מיקס', המכיל אנזים 'טרנסקריפטאז הפוך' הממיר את ה-RNA ל-DNA. תערובת מאסטר מכילה Taq polymerase, האנזים שיוצר עותקים של ה-DNA, נוקלאוטידים, כמו גם אלמנטים אחרים כמו מגנזיום - יון שלו נחוץ כדי להגביר את ה-DNA.

תערובת ה-PCR מכילה גם 'ריאגנטים' כגון 'פריימרים' ו'בדיקות'. פריימרים הם גדילים מסוימים של DNA שנועדו להיקשר ל-DNA שיש להעתיק; בדיקות משמשות לזיהוי הרצף הספציפי בדגימת ה-DNA. ארגון הבריאות העולמי המליץ ​​על פריימרים ובדיקות ספציפיות לבדיקת COVID-19.

לבסוף, תערובת ה-PCR מורכבת מגן משק בית - גן אנושי רגיל (RNase P) המשמש כדי להבטיח שדגימות נאספו כראוי, ו-RNA מופק.

AmpLification של ה-DNA הנגיפי

דגימה, בתמהיל ה-PCR שלה, מוכנסת לצינורות או לצלחות, אשר מוכנסות לאחר מכן למכונת מחזור תרמית המשמשת לביצוע תהליך ה-PCR.

ראשית, ה-RNA מומר ל-DNA. ואז מתחיל תהליך העתקת הגנים. המחזור התרמי מחמם ומצנן את התערובת עם הדגימה, לסירוגין בין שלוש טמפרטורות - להמסת ה-DNA כדי להפריד בין שני הגדילים, כדי שהפריימר ייקשר ל-DNA, ולסינתזה של גדיל חדש - הכל בתוך מחזור אחד שנמשך זמן רב. דַקָה. המחזור התרמי מפעיל 30-40 מחזורים כאלה על מנת להגביר את ה-DNA כדי לבדוק את הנגיף.

בדיקה מול בקרות

DNA מוגבר נבדק נגד בקרה חיובית, המורכבת בדרך כלל מגנים של הנגיף המשובטים לפלסמיד, ובקרה שלילית, שהיא דגימה 'ידועה' שנבדקה שלילית לנגיף קודם לכן.

RNase P צריך להראות הגברה, שליטה חיובית צריכה להיות חיובית, שליטה שלילית צריכה להיות שלילית, ואז כל תוצאה שתקבל עבור הדגימה, היא התוצאה הנכונה, אמר הנוירו-וירולוג ד'ר V Ravi. על מנת שמבחן יהיה תקף לפני פרסום התוצאה, יש לעמוד ב'קריטריוני תוקף' מסוימים.

אל תפספסו מ-Explained | כיצד פועלת בדיקת COVID-19

אם גן משק הבית (RNase P) חיובי, הבקרה החיובית היא חיובית, הבקרה השלילית היא שלילית, והדגימה אינה מציגה שום תוצאה חיובית ל-PCR, הדגימה הוכרזה שלילית ל-RNA של וירוס SARS-CoV-2. אם תוצאת ה-PCR חיובית, למטופל יש COVID-19.

שתף עם החברים שלך: